新墨西哥大学教授杰里米·爱德华兹（Jeremy Edwards）研究了能够更快、更准确地追踪 COVID 和其他呼吸道病毒的新技术。来源：新墨西哥大学
原子力显微镜的主要工作模式有静态模式和动态模式两种。在静态模式中，悬臂从样品表面划过，从悬臂的偏转可以直接得知表面的高度图。在动态模式中，悬臂在其基频或谐波或附近振动，而其振幅、相位和共振与探针和样品间的作用力相关，这些参数相对外部参考的振动的改变可得出样品的性质。
新墨西哥大学计算基因组学和技术 (CGaT) 实验室主任 Jeremy Edwards 和他在加利福尼亚州帕洛阿尔托的 Centrillion Technologies 和西弗吉尼亚大学的同事开发了一种芯片，该芯片提供了一种更简单、更快速的方法对COVID-19等病毒进行基因组测序。
他们的研究题为“基于芯片的SARS-CoV-2临床样本的高精度重测序”，最近发表在美国化学学会的Langmuir杂志上。作为研究的一部分，科学家们创建了一个他们为快速和廉价的全病毒基因组重测序而开发的平铺基因组阵列，并应用他们的 SARS-CoV-2 特异性基因组平铺阵列快速准确地对来自患者的八个临床样本的病毒基因组进行重测序在怀俄明州，SARS-CoV-2 检测呈阳性。最终，他们能够以超过 99.9% 的准确率对每个样本的 95% 基因组进行测序。
SARS-CoV-2 全基因组序列。来源：新墨西哥大学
“这项新技术可以更快、更准确地追踪 COVID 和其他呼吸道病毒，包括新变体的出现，”UNM 化学与化学生物学系教授 Edwards 说。“通过这种简单而快速的测试程序，科学家将能够更准确地跟踪进展情况，并更好地预防下一次大流行的发生。”
全球有超过 1.42 亿人感染了该病毒，因此警惕检测和接触者追踪是减缓 COVID-19 传播的最有效方法。传统的临床检测方法往往会产生假阳性或假阴性，而传统的测序方法既耗时又昂贵。这项新技术将几乎消除所有这些障碍。
“自提交论文以来，该技术进一步发展，准确性和灵敏度得到提高，”爱德华兹说。“芯片技术是大规模病毒基因组监测和病毒变异监测的最佳可用技术。这项技术不仅可以帮助控制这种流行病，还可以预防未来的流行病。”